MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 35859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	CAAAT	2	10	8	17	60 %	20 %	0 %	20 %	157414323
2	NC_009839	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
3	NC_009839	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	157414323
4	NC_009839	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	157414323
5	NC_009839	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
6	NC_009839	AGCG	2	8	210	217	25 %	0 %	50 %	25 %	157414323
7	NC_009839	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414323
8	NC_009839	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
9	NC_009839	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
10	NC_009839	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414323
11	NC_009839	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414323
12	NC_009839	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414323
13	NC_009839	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414323
14	NC_009839	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
15	NC_009839	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414323
16	NC_009839	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414323
17	NC_009839	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414323
18	NC_009839	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414323
19	NC_009839	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	157414323
20	NC_009839	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
21	NC_009839	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	157414323
22	NC_009839	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414323
23	NC_009839	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	157414323
24	NC_009839	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	157414323
25	NC_009839	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414323
26	NC_009839	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414323
27	NC_009839	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
28	NC_009839	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
29	NC_009839	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	157414324
30	NC_009839	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414324
31	NC_009839	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414324
32	NC_009839	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	157414324
33	NC_009839	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
34	NC_009839	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157414324
35	NC_009839	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414324
36	NC_009839	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414324
37	NC_009839	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157414324
38	NC_009839	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	157414324
39	NC_009839	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
40	NC_009839	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
41	NC_009839	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414324
42	NC_009839	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157414324
43	NC_009839	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
44	NC_009839	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414324
45	NC_009839	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
46	NC_009839	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	157414324
47	NC_009839	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414324
48	NC_009839	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
49	NC_009839	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	157414324
50	NC_009839	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414324
51	NC_009839	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414324
52	NC_009839	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414324
53	NC_009839	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414324
54	NC_009839	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	157414325
55	NC_009839	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414325
56	NC_009839	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414325
57	NC_009839	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	157414325
58	NC_009839	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	157414325
59	NC_009839	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157414325
60	NC_009839	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	157414325
61	NC_009839	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
62	NC_009839	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	157414325
63	NC_009839	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
64	NC_009839	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157414325
65	NC_009839	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414325
66	NC_009839	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	157414325
67	NC_009839	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
68	NC_009839	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
69	NC_009839	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	157414325
70	NC_009839	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	157414325
71	NC_009839	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414325
72	NC_009839	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157414325
73	NC_009839	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	157414325
74	NC_009839	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	157414325
75	NC_009839	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414325
76	NC_009839	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157414325
77	NC_009839	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
78	NC_009839	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157414325
79	NC_009839	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157414325
80	NC_009839	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
81	NC_009839	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
82	NC_009839	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157414325
83	NC_009839	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157414325
84	NC_009839	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414325
85	NC_009839	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414325
86	NC_009839	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	157414325
87	NC_009839	ATTT	2	8	4142	4149	25 %	75 %	0 %	0 %	157414325
88	NC_009839	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157414325
89	NC_009839	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
90	NC_009839	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	157414325
91	NC_009839	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	157414325
92	NC_009839	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414325
93	NC_009839	TCG	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157414325
94	NC_009839	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
95	NC_009839	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157414325
96	NC_009839	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
97	NC_009839	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
98	NC_009839	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
99	NC_009839	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	157414325
100	NC_009839	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414325
101	NC_009839	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414325
102	NC_009839	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414325
103	NC_009839	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414326
104	NC_009839	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	157414326
105	NC_009839	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414326
106	NC_009839	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414326
107	NC_009839	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	157414326
108	NC_009839	CATC	2	8	5055	5062	25 %	25 %	0 %	50 %	157414326
109	NC_009839	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157414326
110	NC_009839	TGCA	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	157414326
111	NC_009839	AATC	2	8	5169	5176	50 %	25 %	0 %	25 %	157414326
112	NC_009839	T	7	7	5246	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	157414326
113	NC_009839	GCAT	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	157414327
114	NC_009839	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	157414327
115	NC_009839	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157414327
116	NC_009839	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414327
117	NC_009839	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157414327
118	NC_009839	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
119	NC_009839	T	6	6	5692	5697	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
120	NC_009839	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157414327
121	NC_009839	ACAA	2	8	5771	5778	75 %	0 %	0 %	25 %	157414327
122	NC_009839	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157414327
123	NC_009839	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414327
124	NC_009839	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414327
125	NC_009839	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414327
126	NC_009839	T	6	6	6117	6122	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
127	NC_009839	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157414327
128	NC_009839	T	6	6	6143	6148	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
129	NC_009839	TCTT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	157414327
130	NC_009839	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157414327
131	NC_009839	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414327
132	NC_009839	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157414327
133	NC_009839	GATA	2	8	6322	6329	50 %	25 %	25 %	0 %	157414327
134	NC_009839	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
135	NC_009839	A	6	6	6390	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	157414327
136	NC_009839	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	157414327
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138	NC_009839	TTGTT	2	10	6483	6492	0 %	80 %	20 %	0 %	157414327
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